双系统手机的主要缺点包括：

占用存储空间：

安装两个操作系统需要占用更多的存储空间，可能会导致存储空间不足的问题。

增加系统负担：

同时运行两个操作系统会增加手机的系统负担，可能会导致手机运行变慢或出现其他问题。

不兼容问题：

不同的操作系统版本可能存在不兼容的问题，例如无法同时运行两个操作系统版本的应用程序。

切换系统不便：

当前状态下，只有一个系统是在运行的，不能随意切换。如果想要进入另外一个系统，就要重新启动，重新选择。

电池和内存影响：

在切换系统时，一个系统打开，另一个系统就会自行冻结，操作时会对手机电池耗电速度以及运行内存造成些微的影响。

功能冗余：

双系统手机虽然功能强大，但并非所有功能都需要，可能会导致一些功能冗余和不必要的复杂性。

第三方软件限制：

使用分身功能多为第三方软件，而使用第三方软件分身可能会被封号。

综上所述，双系统手机虽然提供了在某些特定场景下的便利，但总体来说，其缺点和限制较多，普通用户可能并不需要如此复杂的功能。如果确实需要，建议优先考虑虚拟机等其他解决方案。