魔力宝贝手游中的副本主要包括以下几种：

古文明遗迹

海贼巢穴

冰雪牢城

凤鸣之塔

精灵遗迹

失落古代文明

久远之歌

随机迷宫

这些副本分为单日版和双日版，玩家需要根据副本的要求和开启时间进行参与。副本的产出包括经验、金钱、宠物技能药水、宠物糖果、宠物训练饼等。

建议玩家根据自己的等级和游戏进度选择合适的副本进行挑战，以获得更多的资源和奖励。