PE系统修复系统的方法主要包括以下几种：

使用PE启动U盘修复

制作一个PE启动U盘，插入电脑并重启，进入BIOS设置将启动顺序设置为U盘启动。

在PE系统中，使用文件资源管理器复制需要的文件到其他盘，避免复制到C盘以免重装系统丢失数据。

使用DiskGenius恢复误删除文件

在PE系统中加载DiskGenius，选择需要恢复的分区，使用快速恢复或深度恢复功能找回文件。

使用Ghost备份还原

在PE系统中打开Ghost，选择本地磁盘镜像文件，选择高压缩率进行备份，建议分区备份以提高备份速度。

使用引导修复工具

使用NT6 HDD或引导修复王等工具修复Windows 7/8/10的启动项引导问题。

使用分区工具

处理磁盘分区故障，如恢复丢失的分区或修复分区表。

使用PE工具箱

使用CPU-Z查看硬件详细信息，硬盘检测工具进行坏道扫描和smart信息分析，内存测试工具排除内存故障，系统优化工具进行注册表清理、驱动备份和还原、垃圾文件清理等。

修改BOOT.INI文件

在PE系统中修改C盘下的BOOT.INI文件，使其能够正确引导系统启动。

使用GHOST32软件

在PE系统中使用GHOST32软件进行系统备份和恢复。

编辑注册表

在PE系统中启动注册表编辑器，加载故障或系统的注册表文件，进行修复。

安装网卡驱动

在PE系统中安装缺失的网卡驱动，确保系统能够正常启动网络。

在执行上述修复操作之前，建议先备份重要数据，以防数据丢失或损坏。同时，确保使用的PE系统来源可靠，避免使用不明来源的PE工具，以免引入新的安全问题。