网络游戏最怕的部门包括：

文化部门：

负责网络游戏的内容审查和管理，确保游戏内容符合国家的文化政策和法律法规。

工商部门：

负责网络游戏公司的宣传和广告管理，防止虚假宣传和不正当竞争行为。

公安部门：

负责网络游戏中的网络违法犯罪行为的打击和监管，包括网络诈骗、色情、暴力等内容。

版权局：

负责处理涉及网络游戏的著作权纠纷和投诉。

12318网络游戏投诉中心：

这是一个专门针对网络游戏投诉的平台，游戏公司可以通过这个平台处理玩家投诉。

未成年游戏投诉部门：

一些省市设立了专门的未成年游戏投诉或专属举报平台，以保护未成年人的权益。

综上所述，网络游戏公司最怕的部门主要是文化、工商、公安等行政部门，以及12318网络游戏投诉中心和未成年游戏投诉部门。这些部门共同构成了对网络游戏行业的全面监管体系，确保游戏市场的健康有序发展。