魅族手机使用的是 Flyme系统。Flyme是魅族基于Android操作系统为智能手机量身打造的操作系统。它在2012年6月25日将基于Android 4.0.3的手机操作系统正式确立为“Flyme”。Flyme集成了桌面、联系人、便笺、文档、相机、内置软件、日历、信息、通话记录、设置项的数据同步功能，并整合了互联网公司的云服务等。此外，魅族手机还可以升级到Flyme 6系统，用户可以在手机设置-关于手机中查看手机系统版本和内核版本。