数控系统通过以下指令进行控制：

M指令：

辅助功能指令，用于机床加工操作时的工艺性指令，如M00（程序暂停）、M01（程序选择性停止）、M02（程序结束）、M03/M04/M05（控制主轴的指令）。

G指令：

准备功能指令，用于建立机床或控制系统工作方式，如G00（快速定位）、G01（直线插补）、G02（顺时针圆弧插补）、G73（封闭轮廓复合循环）。

F指令：

进给功能指令，用于指定切削的进给速度，如每分钟进给（G94）和每转进给（G95）。

T指令：

刀具功能指令，用于系统对各种刀具的选择，如T0101（选择刀具编号1，偏置值为00）。

S指令：

主轴转速功能指令，用于指定主轴转速，单位为r/min。

P和R指令：

在一些数控系统中，还可以用P指令暂停时间，用R指令指定圆弧的半径。

这些指令共同构成了数控系统控制机床运动的基础，通过合理组合和使用这些指令，可以实现各种复杂的加工需求。